Background
As a great opportunistic pathogen, Staphylococcus epidermidis participates in a wide spectrum of infections by residing in the medical devices. Regardless of the clinical importance of S. epidermidis, there are a few data about typing of clinical and non-clinical isolates at the subspecies level in Iran. We used the technique of �Multiple-Locus Variable number tandem repeat Analysis� for genetic differentiation of 107 clinical and non-clinical S. epidermidis isolates
Methods
Five appropriate Tandem Repeats were selected using bioinformatics programs and PCR-amplified using specific primers. Clustering of the �Multiple-Locus Variable number tandem repeat Analysis� profile was performed using BioNumerics. All isolates yielded a PCR product for all Variable Number Tandem Repeat loci
Results
Approximately 28% of the isolates were Methicillin Resistant S. epidermidis. High level of genetic diversity between isolates was observed. Overly, the S. epidermidis isolates were discriminated into 43 various �Multiple-Locus Variable number tandem repeat Analysis� types. Twenty-seven isolates obtained from blood showed in 21 �Multiple-Locus Variable number tandem repeat Analysis� types, and 10 samples collected from the environment were distributed in three Multiple-Locus Variable number tandem repeat Analysis� types. There was a significant relationship between the Multiple-Locus Variable number tandem repeat Analysis types and isolated strains of blood and the environment indicating the successful colonization of environmental clones in the hospitalized patients in the surgical ward
Conclusions
The Multiple-Locus Variable number tandem repeat Analysis technique showed information about the transmission of this bacterium among patients, staff and the hospital environment
Riassunto
L�analisi TRs ha documentato la trasmissione ospedaliera di S. epidermidis tra i pazienti
Premessa
Nella sua veste di importante patogeno opportunistico, S. epidermidis � responsabile di un ampio spettro di di infezioni, se presente nei dispositivi medici. Indipendentemente dalla sua importanza clinica, abbiamo a disposizione in Iran pochi dati sulla tipizzazione degli isolamenti clinici e non-clinici di S. epidermidis a livello di sottospecie. Per ottenerne di pi� abbiamo utilizzato la tecnica della �Multiple-Locus Variable number tandem repeat Analysis� per la differenziazione genetica di 107 stipiti, clinici e non clinici, di S. epidermidis
Materiali e Metodi
Cinque appropriate sequenze in tandem sono state selezionate utilizzando programmi di bioinformatica e amplificate con PCR usando primer specifici. Il raggruppamento dei profili ottenuti con la �Multiple-Locus Variable number tandem repeat Analysis� � stato realizzato usando il software Bionumerics. Tutti gli isolamenti hanno dato un prodotto PCR per tutti i loci della Variable Number Tandem Repeat
Risultati
Nel 28% dei casi I ceppi di S. epidermidis era meticillino-resistenti, con un elevato livello di diversit� genetica tra di loro. In aggiunta, i ceppi di S. epidermidis sono stati distinti in 43 diversi tipi secondo la Multiple-Locus Variable number tandem repeat Analysis. Ma mentre 27 ceppi di isolamento clinico (sangue) mostrarono 10 tipi diversi, i 10 ceppi ambientali ne mostrarono solo 3. Si � evidenziata un significativa relazione tra i tipi ottenuti con la �Multiple-Locus Variable number tandem repeat Analysis� ed i ceppi isolati da sangue ed ambiente, e ci� sta ad indicare il successo della colonizzazione, da parte dei ceppi ambientali, dei pazienti ospedalizzati nei reparti chirurgici
Conclusioni
La tecnica della �Multiple-Locus Variable number tandem repeat Analysis� ha fornito interessanti informazioni sulla trasmissione di S. epidermidis tra pazienti, personale ed ambiente ospedaliero
